核心摘要：2020年第45号公告仍是软件和集成电路企业所得税优惠的重要依据，但旧政策衔接、年度清单、企业条件和申报资料必须一起核对。软件企业税收优惠不能只看行业评估证书，还要接受主管税务机关审核。
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45号公告现在还适用吗？
《财政部、税务总局、发展改革委、工业和信息化部关于促进集成电路产业和软件产业高质量发展企业所得税政策的公告》（2020年第45号）仍是现行软件和集成电路企业税收优惠体系中的重要政策依据。它解决的是优惠主体、优惠期限、重点主体和清单管理等问题；企业实际申报时，还要结合当年度政策通知、企业条件和主管税务机关要求。
国家税务总局的软件企业和集成电路企业税费优惠政策指引列明了软件产品增值税即征即退、国家鼓励主体定期减免企业所得税等项目，并列出45号公告及后续文件作为政策依据。旧文章只回答2021年前的执行问题，不能替代当年度清单和电子税务局申报提示。
2019年前进入优惠期的企业怎么衔接？
需要把企业分成两类判断：
- 2019年（含）以前已经进入原政策优惠期。 符合原有政策条件的，可以按原有政策继续享受至期满；企业仍要保存当年进入优惠期的证明和每个年度的申报资料。
- 2019年（含）以前尚未进入优惠期。 不能因为过去取得过行业评估或有软件著作权，就直接套用原政策。应按45号公告、现行企业条件和当年度清单或审核规则重新判断。
企业若同时符合多项定期减免税优惠，通常应按规定选择其中一项，不能把不同政策的免税期限重复叠加。具体起算年度、剩余期限和申报方式，应以企业所得税汇算清缴年度的政策文件和主管税务机关口径为准。
软件企业清单和双软评估怎么区分？
软件企业清单和行业评估不是同一环节？
“双软评估”通常指软件产品评估、软件企业评估等行业服务；税收优惠清单则是国家有关部门按年度组织的政策管理环节。两者可能存在材料交叉，但法律作用和审核主体不同。企业不能把协会评估证书当成享受企业所得税优惠的自动通行证，也不能把软件著作权登记证书直接等同于软件企业资格。
今年应该看哪些证据？
先查当年度是否发布软件和集成电路企业清单通知，再核对企业是否满足主营收入、研发投入、研发人员、知识产权、开发环境和合法经营等条件。清单、条件和申报表之间要保持一致；如果企业所在地要求通过指定系统填报，还要保存提交回执和更正记录。
所得税和增值税优惠分别怎么判断？
企业所得税定期减免
国家鼓励主体自获利年度起，第一年至第二年免征企业所得税，第三年至第五年按25%法定税率减半征收。享受条件包括独立法人、软件主营业务、研发人员和研发费用比例、软件收入结构、知识产权、开发环境及合法经营等，比例和条件以当年度政策为准。
软件产品增值税即征即退
一般纳税人销售自行开发生产的软件产品，按照现行政策征收增值税后，实际税负超过3%的部分可按规定申请即征即退。通常需要有计算机软件著作权登记证书，并能证明产品、销售、发票、进项和增值税申报之间的对应关系。退税款如果专项用于软件产品研发和扩大再生产并单独核算，企业所得税处理还要满足政策条件，不能只看收款记录。
企业可通过企业所得税年度申报表新变化指南复核汇算表单，通过财税顾问服务和代理记账服务整理研发辅助账、发票和申报勾稽关系。
申报前资料怎么准备？
建议按“资格—数据—申报—留痕”四步准备：
- 资格。 保存营业执照、知识产权、软件产品资料、开发环境和质量管理制度。
- 数据。 按项目归集研发费用，统计本科及以上人员、研发人员、软件收入和境内研发费用等指标。
- 申报。 核对清单或审核结果、企业所得税优惠事项、增值税即征即退申请及电子税务局表单。
- 留痕。 下载申报回执、缴款或退税凭证、审核通知和更正记录，至少与当年度账簿和辅助账一并归档。
北京、济南企业在申报前应先确认主管税务机关、行业主管部门和当年度清单通知的最新要求；政策文件、清单和系统口径不一致时，应以主管机关书面或系统提示为准。
常见问题解答
Q：2020年第45号公告现在还适用吗？ A：45号公告仍是软件和集成电路企业所得税优惠的重要政策依据，但企业能否享受要结合当期清单、企业条件、优惠期限和主管税务机关要求判断，不能只凭旧问答或行业证书申报。
Q：2019年以前已经进入优惠期的企业怎么衔接？ A：符合原有政策且在2019年含以前已经进入优惠期的企业，可以按原有政策继续享受至期满；尚未进入优惠期的，不应直接沿用旧政策，需按现行45号公告及清单管理规则重新判断。
Q：软件企业清单和双软评估证书是一回事吗？ A：不是一回事。软件行业协会的产品或企业评估属于行业服务，清单是享受特定税收优惠的政策管理环节；评估证书不能自动替代清单、条件审核或企业所得税申报资料，软件企业税收优惠仍需按年度规则申报。
Q：软件产品增值税即征即退需要什么条件？ A：一般纳税人销售自行开发生产的软件产品，软件产品通常应取得计算机软件著作权登记证书，并按财税规则核算实际税负；超过3%的部分是否退税，还要按发票、产品和申报资料接受主管税务机关审核。
Q：企业申报软件税收优惠要留存哪些资料？ A：应留存营业收入、研发费用辅助账、人员和劳动关系、知识产权、软件产品销售、增值税申报、清单或审核结果及优惠申报表等资料，资料之间要能相互勾稽，并以当年度公告和电子税务局要求为准。
